1989年：制定中小学常规管理基本要求　1989年，省教委颁布《江苏省中小学常规管理基本要求》，对校园管理、教师管理、学生管理、教育教学工作管理、后勤工作管理、资料档案管理提出了基本要求。

1990年：实现“一无两有”奋斗目标　自1983年启动“一无两有”工程以来，经过7年的奋斗，到1990年，我省中小学基本达到“校校无危房、班班有教室、学生人人有课桌凳”的要求。

1991年：提出实施素质教育　1990年底，省教委颁发《关于当前小学教育改革的意见（试行）》。1991年初，该文件陆续下发到各市、县教育局，实施素质教育在江苏正式提出。此后，省教委召开了第一次素质教育研讨会，形成了《江苏省小学素质教育基本要求》初稿。

1992年：迈出高校联合的步伐　经过几年的准备，1992年，经国家教委批准，在原扬州师范学院、江苏农学院、江苏水利工程专科学校、江苏商业专科学校、扬州工学院、扬州医学院的基础上，联合组建扬州大学。联合办学及以后开展的高校布局结构调整，逐步改变了我省高等教育小而全、小而散的局面。

1993年：进行高等学校“211工程”建设　1993年，中共中央、国务院在《中国教育改革与发展纲要》中提出高等教育“211工程”建设规划，我省先后有南京大学、东南大学、南京理工大学、南京航空航天大学、河海大学、中国矿业大学、中国药科大学、南京农业大学、无锡轻工业学院等部委直属高校和南京师范大学、苏州大学等省属高校制定规划，申请进入国家“211工程”建设行列。

1994年：提出并开始实施“科教兴省”战略　1994年，省委、省政府召开全省教育工作会议，正式将“科技兴省”战略充实为“科教兴省”战略，并制定了全面实施《中国教育改革和发展纲要》的意见，明确到2000年我省教育改革和发展的指导思想、总体战略、目标任务、改革思路和关键措施。

1995年：组织实施教育现代化工程　1995年11月，省教委在锡山市召开全省教育现代化工程实施工作现场会。会上，根据省委提出的到本世纪末全面实现小康、到2010年基本实现现代化的目标要求，省教委要求各地把实施教育现代化工程、实现教育现代化作为今后15年乃至更长时间里教育改革和发展的主要任务。

1996年：实现“两基”并率先进行高校扩招　经过10年的奋斗，1996年我省106个县（市、区）全部普及了9年义务教育，并达到基本扫除青壮年文盲的要求。国家教委检查验收后发布了《江苏、广东两省各市（县、区）全面实现“两基”目标》的新闻公报。根据经济建设对专门人才的需求，我省作出了从1996年开始大学每年增招l万人的重要决策，率先扩大高等教育招生规模。

1997年：启动改造义务教育阶段薄弱学校行动计划　1997年3月，我省启动改造义务教育阶段薄弱学校行动计划。该计划要求，每年改造义务教育阶段薄弱学校1000所，4年内完成改造任务。

1998年：扩大5年制高职教育试点　在前期试点的基础上，1998年我省作出了扩大5年制高职试点的重要决策。4月，省教委、计经委、财政厅、人事厅、物价局五部门联合印发《关于我省重点中等专业学校举办5年制专业班有关问题意见的通知》，决定在26所重点中专学校举办5年制专业班。

1999年：创办普通高校民办二级学院　1999年1月，省教委召开座谈会，通报有关普通高校建立公有民办二级学院基本原则精神。公有民办二级学院引入民办机制，并实行“三独立”（独立法人、独立校舍、独立财务），经审查符合条件方可安排招生，实行单独编班和组织教学。

2000年：进行高等教育管理体制重大调整　为改变高等教育条块分割的状况，国家陆续将部分部委办院校交由地方管理。2000年，我省接收了第三批划转我省管理的11所普通高校和2所成人高校。南京林业大学、南京建筑学院、南通医学院、南京审计学院、南京邮电学院、南京气象学院等高校，实行中央与地方共建，以地方管理为主。